Привлекательна для посетителей музея витрина природных и синтетических (обр. 55/25) самоцветов. Кроме уральских изумруда, малахита, аметиста, авантюрина, уваровита (обр. 65/1), памирского лазурита, образцов лазурита и гелиодора из месторождений Забайкалья, эвдиалита и амазонита с Кольского полуострова, здесь можно увидеть новый самоцвет Сибири - чароит. Разнообразны и цветные камни дальневосточных месторождений. Хромдиопсид месторождения Инагли (обр. 5/537) имеет зеленый цвет с различными оттенками от светлого до почти черного, характерную призматическую спайность и приуроченные к ней минеральные включения (магнетит, биотит). Отдельные призматические кристаллы по своим качествам приближаются к изумруду.
      Ирнимит - «синяя яшма» (обр. 56/1) - аналогов в мире не имеет. Месторождение расположено в северо-западных отрогах Тайканского хребта в бассейнах рек Ира и Ними (Хабаровский край) на площади развития марганцеворудной толщи. Характерный признак ирнимита - наличие ярких синих прожилков и пятен (до 40х8 м) в вишневой, оранжевой, серой яшмовидной породе. Ирминит, в отличие от яшмы, является микрокварцитом, синие цвета которого обусловлены рассеянным в массе кварца амфиболом.
Сахалинский янтарь, получивший название «сахалинит», по своим качествам не уступает прибалтийскому. Он имеет цвет густого чая с вишневым оттенком. Вымывается из угленосных толщ.. Сахалинский родонит используется для изготовления камнерезных изделий.
      В этой же витрине - окатанные обломки кристаллов сапфира и гиацинта из золотоносных россыпей бассейна реки Кедровки в Приморском крае (месторождение Радужное). По оценкам экспертов, они представляют собой высококачественное ограночное сырье. Размеры кристаллов сапфира достигают 15х20мм, по характеру окраски выделяют несколько драгоценных разновидностей: синие с различными оттенками, зеленые, жемчужно-серые с эффектом "кошачьего глаза", полихромные с резкой границей синего и зеленого цветов, серовато-синие с астеризмом. Гиацинт имеет привлекательный оранжево-красный или ярко-красный цвет.