Тематика научных исследований ДВГИ ДВО РАН соответствует направлениям научных исследований Института и основным направлениям Программы фундаментальных научных исследований государственных академий наук на 2013–2020 годы. Основными направлениями фундаментальных исследований ДВГИ ДВО РАН, утвержденными постановлением Президиума РАН от 20.06.2006 г. № 201, являются:

• геология, динамика литосферы, магматизм и метаморфизм зоны перехода континент–океан;
• металлогения типовых геодинамических обстановок;
• геоэкология, взаимодействие атмо-, био, гео- и гидросферы в современных геоэкологических системах Тихоокеанского региона.

 В 2013–2016 годах исследования в Институте проводились по 5 бюджетным темам НИР. С 2017 года выполняется 4 темы. Получены значимые научные результаты, имеются научно-практические разработки инновационного характера, многие из которых готовы к практической реализации.